在《Metal Gear Solid 4》事件过去数年后，半机械人士兵 Raiden 成为一名私人安保人员，努力摆脱自己充满暴力的过去。然而，当私人军事公司 Desperado Enforcement 为了牟取利益而掀起新的战争时，他的任务彻底改变。随着 Raiden 揭开涉及儿童兵、先进义体技术以及政治操纵的巨大阴谋，他不仅要面对强大的敌人，也必须直面自己内心最黑暗的一面。在盟友的帮助下，他与令人难忘的对手以及大批机械化士兵展开激烈战斗。在保护无辜者的信念与内心“Jack the Ripper”的嗜血本能之间挣扎时，Raiden 必须决定自己究竟要成为怎样的战士。整个故事将高速动作战斗、哲学思考与震撼场面完美结合，谱写出一段关于复仇与救赎的难忘旅程。