Vários anos após os acontecimentos de Metal Gear Solid 4, o soldado ciborgue Raiden trabalha como agente de segurança privada, tentando deixar seu passado violento para trás. Sua missão muda drasticamente quando a empresa militar privada Desperado Enforcement inicia uma campanha brutal para alimentar guerras em busca de lucro. Ao descobrir uma conspiração envolvendo crianças-soldado, tecnologia cibernética avançada e manipulação política, Raiden precisa enfrentar inimigos poderosos e o lado mais sombrio de sua própria natureza. Com a ajuda de seus aliados, ele enfrenta adversários memoráveis e exércitos de ciborgues. Dividido entre proteger os inocentes e o retorno de seu lado "Jack the Ripper", Raiden deve decidir que tipo de guerreiro realmente deseja ser. A história combina ação intensa, temas filosóficos e batalhas espetaculares em uma inesquecível jornada de vingança e redenção.