Metal Gear Solid 4 की घटनाओं के कई वर्षों बाद, साइबोर्ग सैनिक Raiden एक सुरक्षा ऑपरेटिव के रूप में काम करता है और अपने हिंसक अतीत को पीछे छोड़ना चाहता है। लेकिन उसकी ज़िंदगी तब बदल जाती है जब निजी सैन्य संगठन Desperado Enforcement लाभ के लिए युद्धों को भड़काने का क्रूर अभियान शुरू करता है। बच्चों को सैनिक बनाने, उन्नत साइबरनेटिक तकनीक और राजनीतिक षड्यंत्र से जुड़ी साजिश का पर्दाफाश करते हुए Raiden को शक्तिशाली दुश्मनों और अपने भीतर छिपे अंधेरे पक्ष का सामना करना पड़ता है। अपने साथियों की मदद से वह यादगार विरोधियों और साइबोर्ग सेनाओं से भिड़ता है। निर्दोषों की रक्षा करने की अपनी इच्छा और अपने भीतर के "Jack the Ripper" के बीच संघर्ष करते हुए, Raiden को तय करना होता है कि वह वास्तव में कैसा योद्धा बनना चाहता है। यह कहानी तेज़-तर्रार एक्शन, दार्शनिक विचारों और शानदार युद्ध दृश्यों को बदले और मुक्ति की अविस्मरणीय यात्रा में पिरोती है।