Спустя несколько лет после событий Metal Gear Solid 4 киборг-солдат Raiden работает в частной охранной компании, пытаясь оставить своё жестокое прошлое позади. Однако его миссия принимает неожиданный оборот, когда частная военная компания Desperado Enforcement начинает беспощадную кампанию по разжиганию войн ради прибыли. Раскрывая заговор, связанный с детьми-солдатами, передовыми кибернетическими технологиями и политическими манипуляциями, Raiden сталкивается не только с могущественными врагами, но и с собственной тёмной стороной. При поддержке союзников он сражается с запоминающимися противниками и армиями киборгов. Разрываясь между желанием защищать невинных и пробуждением своей личности "Jack the Ripper", Raiden должен решить, каким воином он хочет стать. История сочетает стремительный экшен, философские идеи и зрелищные сражения в незабываемом путешествии мести и искупления.