Quake II Enhanced segue a mesma história principal do Quake II original, colocando o jogador no papel de um Marine enviado na Operation Alien Overlord para deter os Strogg, um implacável império cibernético que invadiu a Terra. Depois que a força de invasão é quase completamente destruída, o Marine fica preso no planeta dos Strogg e precisa lutar sozinho por complexos militares, instalações industriais e cidades alienígenas. Com o avanço da missão, o objetivo deixa de ser apenas sobreviver e passa a ser destruir a máquina de guerra dos Strogg, sabotando suas defesas, eliminando seus principais comandantes e interrompendo sua rede de comando. A jornada culmina em um confronto decisivo contra Makron, o governante supremo dos Strogg. Quake II Enhanced preserva fielmente essa campanha clássica enquanto adiciona melhorias visuais, recursos modernos e todas as expansões oficiais.

Em Quake Enhanced, você assume o papel de Ranger, um soldado solitário enviado por um sistema de teletransporte defeituoso depois que as bases militares da humanidade são dominadas por uma antiga força misteriosa. Preso entre dimensões distorcidas, ele enfrenta monstros grotescos, soldados implacáveis e criaturas aterrorizantes inspiradas em Lovecraft, todas servindo à entidade maligna Shub-Niggurath. Sua jornada passa por castelos medievais, fortalezas abandonadas, templos amaldiçoados e reinos sombrios onde a própria realidade parece estar se desfazendo. Munido de um poderoso arsenal, ele busca recuperar runas mágicas que são a chave para alcançar a origem da invasão. A cada mundo conquistado, a verdadeira dimensão do poder do inimigo se torna mais evidente. No fim, somente enfrentando Shub-Niggurath em seu próprio domínio será possível pôr fim ao pesadelo e salvar a humanidade.

Situado logo após os acontecimentos de Quake II, Quake 4 acompanha Matthew Kane, um experiente fuzileiro da Rhino Squad que participa da ofensiva decisiva da humanidade contra o mundo dos Strogg. À medida que a invasão se intensifica, Matthew Kane e sua equipe atravessam cidades fortificadas e complexos industriais enfrentando inimigos cibernéticos implacáveis. Após um confronto devastador, Matthew Kane é capturado e submetido a uma terrível transformação conhecida como Stroggification, tornando-se metade humano e metade Strogg. Mesmo assim, ele mantém sua mente humana e ganha novas habilidades que o ajudam a continuar lutando. Com o destino da invasão em jogo, ele avança até o coração do império Strogg para destruir o Nexus e incapacitar sua máquina de guerra. Sua jornada é uma história de sobrevivência, sacrifício e da luta para preservar sua humanidade diante de um dos maiores inimigos do universo Quake.

Quake III Arena possui uma história simples, servindo principalmente como pano de fundo para sua ação intensa e veloz. Através de incontáveis dimensões, a misteriosa e poderosa Vadrigar reúne os maiores guerreiros do universo e os aprisiona em um enorme complexo de arenas. Movidos pela glória, pela sobrevivência ou pelo puro desejo de lutar, esses campeões enfrentam-se em combates e torneios intermináveis. Cada vitória os aproxima de adversários ainda mais poderosos, enquanto cada derrota representa a destruição. As arenas se espalham por mundos alienígenas, templos antigos, instalações industriais e paisagens impossíveis, todas criadas para testar velocidade, precisão e habilidade. Em vez de contar uma história tradicional, o jogo destaca uma competição eterna, na qual apenas o guerreiro mais forte pode conquistar o título de campeão supremo da Arena de Vadrigar.

Em Quake (1996), você assume o papel do veterano Ranger, enviado através do misterioso projeto Slipgate após um experimento sair do controle e permitir que uma força aterrorizante conhecida como Quake invada a realidade. Você atravessa castelos medievais sombrios, bases militares abandonadas, templos antigos e dimensões distorcidas, enfrentando monstros implacáveis criados por magia sombria e tecnologia avançada. Cada mundo revela fragmentos de um reino sinistro governado por horrores ancestrais, enquanto a humanidade luta para sobreviver. Com um arsenal cada vez mais poderoso, você supera armadilhas mortais, criaturas assustadoras e chefes formidáveis. Conforme a jornada avança, a verdadeira origem da invasão é revelada, levando ao confronto final contra Shub-Niggurath, cuja derrota representa a única esperança de selar a fenda dimensional e restaurar a paz.