Quake II Enhanced повторяет основную историю оригинальной Quake II, где игрок берет на себя роль Marine, участвующего в Operation Alien Overlord, чтобы остановить Strogg — беспощадную кибернетическую империю, вторгшуюся на Землю. После того как силы вторжения оказываются почти полностью уничтожены, Marine остается один на родной планете Strogg и вынужден пробиваться через военные базы, промышленные комплексы и инопланетные города. Постепенно его задача превращается из борьбы за выживание в решающую миссию по уничтожению военной машины Strogg, включая диверсии против их обороны, ликвидацию ключевых командиров и разрушение их системы управления. Финалом становится решающее сражение с Makron, верховным правителем Strogg. Quake II Enhanced бережно сохраняет эту классическую кампанию, дополняя ее улучшенной графикой, современными возможностями и всеми официальными дополнениями.

В Quake Enhanced вы играете за Ranger, одинокого солдата, которого отправляют через неисправную систему телепортации после того, как военные базы человечества захватывает древняя загадочная сила. Оказавшись в искажённых измерениях, он сражается с чудовищными монстрами, безжалостными солдатами и кошмарными существами, вдохновлёнными произведениями Lovecraft, служащими зловещей сущности Shub-Niggurath. Его путь проходит через средневековые замки, заброшенные крепости, проклятые храмы и жуткие миры, где сама реальность кажется разрушенной. Используя внушительный арсенал оружия, Ranger ищет магические руны, открывающие путь к источнику вторжения. С каждым новым миром становится всё яснее истинное могущество противника. В финале лишь сразившись с Shub-Niggurath в её собственном мире, он сможет положить конец кошмару и спасти человечество.

События Quake 4 разворачиваются вскоре после окончания Quake II и рассказывают историю Matthew Kane, опытного морского пехотинца из Rhino Squad, участвующего в решающем наступлении человечества на родной мир Strogg. По мере усиления вторжения Matthew Kane и его отряд пробиваются через укреплённые города и промышленные комплексы, сражаясь с беспощадными кибернетическими противниками. После разрушительного столкновения Matthew Kane попадает в плен и подвергается ужасающему процессу Stroggification, превращаясь в существо, сочетающее человека и Strogg. Несмотря на это, он сохраняет человеческий разум и получает новые способности, которые помогают ему продолжить борьбу. Когда судьба вторжения оказывается в его руках, он отправляется в самое сердце империи Strogg, чтобы уничтожить Nexus и вывести из строя их военную машину. Это история о выживании, самопожертвовании и борьбе за сохранение своей человечности перед лицом одного из самых опасных врагов во вселенной Quake.

Quake III Arena обладает очень простой историей, которая служит лишь фоном для стремительных сражений. Сквозь бесчисленные измерения загадочная и всемогущая Vadrigar собирает величайших воинов Вселенной и заточает их в огромном комплексе боевых арен. Стремясь к славе, выживанию или просто наслаждаясь битвой, эти чемпионы бесконечно сражаются друг с другом в смертельных поединках и турнирах. Каждая победа приближает их к ещё более сильным противникам, а каждое поражение означает гибель. Арены расположены на инопланетных мирах, в древних храмах, промышленных комплексах и невероятных ландшафтах, где проверяются скорость, точность и мастерство. Вместо традиционного сюжета игра сосредоточена на вечном состязании, в котором только сильнейший воин способен стать величайшим чемпионом смертоносной Arena Vadrigar.

В Quake (1996) вы играете за закалённого в боях бойца Ranger, отправленного через таинственный проект Slipgate, который вышел из-под контроля и позволил ужасающей силе Quake вторгнуться в реальность. Вам предстоит пройти через мрачные средневековые замки, заброшенные военные базы, древние храмы и искажённые измерения, сражаясь с беспощадными чудовищами, созданными тёмной магией и передовыми технологиями. Каждый новый мир раскрывает части зловещего царства, населённого древними космическими ужасами, где человечество оказалось на грани гибели. Вооружившись всё более мощным арсеналом, вы преодолеваете смертельные ловушки, кошмарных существ и могущественных боссов. Постепенно раскрывается истинная причина вторжения, что приводит к финальной битве с древним существом Shub-Niggurath, поражение которого является единственной надеждой закрыть межпространственный разлом и спасти человечество.