Bionic Commando: Rearmed suit l’histoire de Nathan “R.A.D.” Spencer, un agent des forces spéciales équipé d’un bras bionique puissant à la suite d’une expérience militaire ratée. Il est envoyé en mission critique lorsque la Fédération découvre que l’ancien régime impérial tente de relancer un projet d’arme dévastatrice appelé “Albatross”. Au cours de l’opération, Spencer infiltre des territoires fortement fortifiés contrôlés par l’Empire Badds. Son objectif principal devient de sauver le légendaire agent Super Joe, qui détient des informations cruciales sur les plans ennemis. En avançant, il découvre la vérité sur le projet Albatross et les intentions de l’Empire de remodeler l’équilibre mondial. Grâce à son bras bionique, il se balance entre les plateformes, grimpe les structures et élimine les ennemis. Plus il progresse, plus il fait face à la trahison et aux sacrifices liés à la guerre. À la fin, il doit affronter les dernières défenses pour empêcher l’activation de “Albatross”.