I.G.I.-2: Covert Strike 的故事发生在前作事件结束后不久，精英特工 David Jones 再次为 Institute for Geotactical Intelligence 执行一系列秘密任务。他的目标是在被盗的 EMP 技术落入恐怖组织和叛变军事势力手中之前将其夺回。为完成任务，David Jones 穿梭于多个国家，潜入戒备森严的军事基地、工业园区和秘密设施。随着行动的深入，他逐渐发现了一场牵涉国际军火商、双面间谍以及复杂政治联盟的大规模阴谋。依靠潜行、精准行动和周密的战术规划，他必须战胜越来越危险的敌人，并阻止一场可能席卷全球的灾难。每一次任务都会揭开阴谋的新线索，最终演变成一场与时间赛跑的紧张较量，而任何一个失误都可能对世界安全造成毁灭性的后果。

《Project I.G.I.: I'm Going In》讲述了英国特种空勤团（SAS）前特工 David Llewellyn Jones 在一个绝密美军组织工作期间执行的高风险任务。受五角大楼指派，在远程联络员 Anya 的协助下，Jones 被空投到东欧腹地，以追踪一枚被盗的美国核弹头。他的任务始于追捕一名掌握着盗窃关键情报的被绑架军火商。随着线索的展开，Jones 揭露了一场由前克格勃（KGB）特工 Ekk 精心策划的灾难性阴谋，该阴谋企图将欧洲变成一片放射性废土。凭借战术潜行、间谍小工具和激烈的枪战，Jones 必须潜入戒备森严的军事基地、黑入安全网络并智胜敌方势力。故事最终演变成一场与时间的绝望赛跑，旨在夺回装置的运作部件并在全球灾难降临前消灭幕后黑手。