Half-Life: Blue Shift は、研究施設 Black Mesa で警備員として働く Barney Calhoun の物語を描いています。施設内で発生したレゾナンス・カスケード事故によって異星生物が解き放たれ、施設全体が混乱に包まれる中、彼は生き残るための戦いを始めます。科学者 Gordon Freeman の冒険とは異なり、Barney の旅は生存、協力、そして仲間たちの救助に重点が置かれています。事故の隠蔽を目的として軍が到着すると、Barney は危険な研究室やエイリアンが徘徊する通路、敵対的な兵士たちを突破しながら脱出方法を探さなければなりません。道中では科学者や警備員を助けながら、災害の真相とその規模を徐々に知っていきます。本作はオリジナルの Half-Life の出来事を別の視点から描き、アクションと緊張感、そして強い意志に満ちた魅力的な並行ストーリーを提供しています。