Half-Life: Opposing Force は、Black Mesa研究施設で発生した大惨事の最中に派遣された若きアメリカ海兵隊員 Adrian Shephard の物語を描いています。その事故によって異星世界へのポータルが開かれました。オリジナル作品では海兵隊が目撃者の排除を任務としていましたが、Shephard は混乱の中に取り残され、敵対的なエイリアンや軍事勢力と戦いながら生き延びなければなりません。状況が悪化する中、彼は地球そのものを脅かす新たな異星の脅威を発見します。破壊された研究施設や軍事施設、エイリアンに侵略された区域を進みながら、Shephard は災害の封じ込めにおいて重要な役割を果たします。本作は Black Mesa 事件を別の視点から描き、Half-Life の世界を新たな敵や武器、そして挑戦でさらに広げています。