Half-Life: Opposing Force narra la historia de Adrian Shephard, un joven marine estadounidense enviado al centro de investigación Black Mesa durante el desastre que abrió portales hacia un mundo alienígena. A diferencia del juego original, donde los marines tenían la misión de eliminar a los testigos, Shephard queda atrapado en medio del caos y debe luchar por sobrevivir contra criaturas extraterrestres y fuerzas militares hostiles. A medida que la situación empeora, descubre una nueva amenaza alienígena que pone en peligro a toda la Tierra. Mientras atraviesa laboratorios destruidos, instalaciones militares y zonas infestadas de alienígenas, Shephard desempeña un papel crucial en la contención de la catástrofe. El juego ofrece una perspectiva única del incidente de Black Mesa y amplía el universo de Half-Life con nuevos enemigos, armas y desafíos.