تدور أحداث Rogue Trooper Redux في ساحة المعركة السامة على كوكب Nu-Earth، حيث يتبع اللاعب قصة Rogue، آخر جندي من فئة Genetic Infantryman (GI) صُمم لتحمل البيئة القاتلة للكوكب. بعد أن تتعرض فرقته للخيانة خلال مهمة كارثية، ينطلق Rogue في مطاردة لا هوادة فيها للعثور على Traitor General المسؤول عن المذبحة. ويرافقه طوال الرحلة الوعي الرقمي لرفاقه الذين سقطوا، والمحفوظ داخل بندقيته وحقيبته وخوذته، بينما يخوض معارك عبر أراضٍ مدمرة مليئة بالجنود المعادين والآلات الحربية والمخاطر القاتلة. ومع تقدم الأحداث، يكتشف Rogue شبكة من الخداع تمتد إلى ما هو أبعد من ساحة القتال، مما يجبره على مواجهة حقائق مؤلمة حول الولاء والتضحية والعدالة. وبإصرار على تكريم ذكرى رفاقه، يواصل القتال متحديًا كل الصعاب سعيًا للانتقام وكشف الحقيقة وراء الخيانة.