Outlast 2は、調査報道記者のBlake Langermannと妻のLynnが、妊娠中の女性の謎の死を調査するためアリゾナ砂漠へ向かうところから始まります。原因不明のヘリコプター墜落事故の後、BlakeはLynnとはぐれ、狂信的な説教師Sullivan Knothが支配する孤立した村Temple Gateに閉じ込められてしまいます。妻を探しながら、彼は凶暴なカルト信者たちから逃げ延びると同時に、現実と過去の記憶の境界を曖昧にする恐ろしい幻覚に苦しめられます。幼少期の心の傷に悩まされながら、彼はカルトの信仰や地域で起きている不可解な現象の恐るべき真実を知ることになります。ビデオカメラだけを頼りに生き延びようとするBlakeは、すべての真実がさらなる恐怖へとつながる悪夢の中を進み、衝撃的で不気味な結末へとたどり着きます。