《Bionic Commando》讲述了前精英士兵 Nathan “Rad” Spencer 的故事，他在被自己的政府背叛后被判处死刑。就在行刑前夕，一个恐怖组织引爆了一种神秘的实验性武器，使整座城市陷入混乱。这次爆炸引发了一系列与秘密军事项目相关的异常事件，该项目涉及先进的生物技术。当 Spencer 的独特生化机械手臂成为在废墟城市中移动的关键工具时，他获得了救赎的机会，这条手臂可以抓取并在建筑间摆荡。他被指派去营救一名被绑架的政府特工并揭开阴谋真相，于是深入敌对区域。在与敌军战斗的过程中，他逐渐意识到这起事件并非偶然。随着调查深入，他揭开了一张将他的过去、军方以及这场灾难联系在一起的谎言之网。最终，这项任务既成为他的生存之战，也成为他夺回自己名誉的个人旅程。

Bionic Commando: Rearmed讲述了特工Nathan “R.A.D.” Spencer的故事，他在一次失败的军事实验后获得了一条强大的生化机械手臂。当联邦发现旧帝国政权试图重新启动名为“Albatross”的毁灭性武器计划时，他被派往执行一项关键任务。在行动中，Spencer潜入由Badds Empire控制的高度防御区域。他的主要目标是营救传奇特工Super Joe，他掌握着敌方计划的重要情报。随着深入任务，他逐渐揭开Albatross计划的真相以及帝国重塑全球格局的野心。他利用生化手臂在建筑间摆荡、攀爬结构并消灭敌人。越深入，他越面对背叛与战争的代价。最终，他必须突破最后防线，阻止“Albatross”的启动。