Warhammer 40,000: Boltgun は、Warhammer 40,000の暗く戦争に満ちた宇宙を舞台にした高速レトロ風FPSで、プレイヤーは重装甲のSpace Marineとして容赦ない浄化任務に従事する。物語は、Chaosの腐敗によって堕落し、異端者や悪魔的存在、歪んだ機械に支配されたForge Worldへの投入から始まる。崩壊した工業地帯を進みながら、皇帝の名の下にあらゆる冒涜を浄化していく。物語は会話よりも戦闘行動を重視している。進むごとにWarp汚染のより深い影響が明らかになる。Boltgunなどの強力な武器を手に、容赦なく敵を殲滅する。Space MarineがImperiumの止まらぬ兵器であることを強調する内容となっている。最終的には、慈悲のない徹底的な浄化の物語である。