Ambientado tras la Segunda Guerra del Tiberium, Command & Conquer 3: Kane's Wrath narra el ascenso, la caída y el regreso del enigmático líder de la Hermandad de Nod, Kane, a lo largo de casi dos décadas de conflicto. La historia se desarrolla desde la perspectiva del leal comandante cibernético LEGION, quien ejecuta los planes secretos de Kane mientras la Hermandad reconstruye su poder tras sufrir derrotas devastadoras. Mientras tanto, GDI refuerza su dominio sobre una Tierra devastada por el Tiberium, mientras Kane manipula los acontecimientos mundiales, descubre antigua tecnología alienígena y prepara a la humanidad para un futuro desconocido. La campaña conecta los sucesos de Tiberian Sun y Tiberium Wars, revelando operaciones secretas, traiciones internas y el verdadero propósito de la visión a largo plazo de Kane. Con misiones cinematográficas y sorprendentes giros estratégicos, esta expansión ofrece una mirada más profunda a uno de los personajes más misteriosos e influyentes de la saga.