Ambientado nos meses finais da Primeira Guerra Mundial, Amnesia: The Bunker acompanha o soldado francês Henri Clément, que desperta preso em um bunker militar subterrâneo abandonado após um ataque devastador. Isolado do mundo exterior e cercado pela escuridão, Henri precisa procurar suprimentos, descobrir o destino dos ocupantes desaparecidos do bunker e encontrar uma maneira de escapar. Ao explorar os corredores labirínticos, ele descobre que uma criatura aterrorizante espreita nas sombras, reagindo a sons e movimentos. Com recursos limitados e uma fonte de luz constantemente diminuindo, cada decisão se torna uma questão de sobrevivência. Quanto mais Henri se aprofunda nos segredos do bunker, mais ele revela um mistério horrível que apaga a linha entre a brutalidade da guerra e algo muito mais sinistro escondido sob a terra.