Amnesia: The Bunker की कहानी प्रथम विश्व युद्ध के अंतिम महीनों में घटित होती है, जहाँ फ्रांसीसी सैनिक Henri Clément एक विनाशकारी हमले के बाद खुद को एक सुनसान भूमिगत सैन्य बंकर में फँसा हुआ पाता है। बाहरी दुनिया से पूरी तरह कटे हुए और चारों ओर फैले अंधकार के बीच, Henri को आपूर्ति जुटानी होती है, बंकर के लापता निवासियों के भाग्य का पता लगाना होता है और बाहर निकलने का रास्ता खोजना होता है। जैसे-जैसे वह जटिल गलियारों की खोज करता है, उसे पता चलता है कि एक भयानक प्राणी छायाओं में उसका पीछा कर रहा है और आवाज़ तथा गतिविधि पर प्रतिक्रिया देता है। सीमित संसाधनों और लगातार घटती रोशनी के साथ, हर निर्णय जीवन और मृत्यु का प्रश्न बन जाता है। बंकर के रहस्यों में गहराई तक उतरते हुए, Henri एक ऐसे भयावह रहस्य का सामना करता है जो युद्ध की क्रूरता और धरती के नीचे छिपी किसी और भी अधिक डरावनी शक्ति के बीच की सीमा को मिटा देता है।