Ambientado após a primeira grande vitória da humanidade contra o Covenant, Halo 2 (2007) acompanha o lendário supersoldado Master Chief Petty Officer John-117 enquanto a Terra sofre um ataque devastador das forças alienígenas. Ao mesmo tempo, o jogador vivencia o conflito pela perspectiva de Arbiter, um Elite do Covenant desonrado que busca recuperar sua honra em missões extremamente perigosas. À medida que os dois heróis descobrem os antigos segredos das misteriosas instalações Halo, acabam envolvidos em uma guerra civil que ameaça destruir o Covenant por dentro. Forças ocultas manipulam ambos os lados, revelando um perigo ainda maior ligado aos antigos Forerunners e ao parasita Flood. Com batalhas épicas pela Terra, mundos alienígenas e enormes mundos em forma de anel, a história explora lealdade, traição, fé e sobrevivência, preparando o caminho para os acontecimentos de Halo 3.