Halo 2 (2007) は、人類が Covenant に対して初めて大きな勝利を収めた直後を舞台に、伝説のスーパーソルジャー Master Chief Petty Officer John-117 が地球への壊滅的な侵略に立ち向かう姿を描きます。同時に、プレイヤーは名誉を失った Covenant のエリート戦士 Arbiter の視点からも物語を体験し、危険な任務を通じて名誉の回復を目指します。二人の主人公は謎に包まれた Halo リングの古代の秘密を解き明かす中で、Covenant を内側から揺るがす内戦へと巻き込まれていきます。さらに、両陣営を操る影の勢力によって、古代文明 Forerunners と恐るべき寄生生命体 Flood に関わる、はるかに大きな脅威が明らかになります。地球や異星世界、巨大なリングワールドを舞台にした壮大な戦いを通して、忠誠、裏切り、信念、そして生き残りが描かれ、Halo 3 へと続く物語が築かれます。