Batman: Arkham Cityでは、Gothamで最も危険な犯罪者たちが、謎めいたHugo Strangeによって管理される巨大な隔離区域「Arkham City」に収容されています。そこへ投獄されたBruce Wayneは、再びBatmanとなり、街全体を脅かす恐るべき陰謀の真相を暴かなければなりません。荒廃した街路や放棄された建物、そしてJoker、Penguin、Two-Faceといった悪名高いヴィランたちが率いるギャングの間を駆け巡りながら、Batmanはこれまでで最も過酷な試練に挑みます。物語は激しいアクション、探偵捜査、そして感動的なドラマを巧みに織り交ぜています。時間が刻一刻と失われ、あらゆる場所に秘密が隠される中、Batmanは強大な敵だけでなく自身の限界とも向き合い、Gothamを破滅から救わなければなりません。