Assassin’s Creed® Chronicles: Trilogy तीन जुड़ी हुई कहानियों को प्रस्तुत करता है, जो चीन, भारत और रूस में घटित होती हैं। इसमें अलग-अलग असैसिन टेम्पलरों के खिलाफ गुप्त युद्ध लड़ते हैं। मिंग कालीन चीन में शाओ जुन बदला लेने और अपने संगठन को फिर से स्थापित करने की कोशिश करती है। औपनिवेशिक भारत में अरबाज़ मीर एक रहस्यमय वस्तु की रक्षा करते हुए टेम्पलरों से लड़ता है। क्रांतिकारी रूस में निकोलाई ओरेलोव रोमानोव परिवार से जुड़ी खतरनाक मिशन में फंस जाता है। इन सभी कहानियों में वफादारी, बलिदान और स्वतंत्रता बनाम नियंत्रण के संघर्ष जैसे विषय साझा हैं।