Assassin’s Creed® Chronicles: Trilogy raconte trois histoires liées se déroulant en Chine, en Inde et en Russie, suivant différents Assassins engagés dans une guerre secrète contre les Templiers. En Chine sous la dynastie Ming, Shao Jun cherche à se venger et à restaurer sa Confrérie. En Inde coloniale, Arbaaz Mir affronte les Templiers tout en protégeant un artefact mystérieux. En Russie révolutionnaire, Nikolai Orelov est impliqué dans une mission liée à la famille Romanov. Malgré leurs différences, ces récits partagent des thèmes de loyauté, de sacrifice et de lutte entre liberté et contrôle, illustrant le combat des Assassins.