Guilty Gear (1998) की कहानी एक ऐसी दुनिया में घटित होती है जो मानवता और Gears नामक शक्तिशाली जैव-इंजीनियर्ड प्राणियों के बीच हुए विनाशकारी युद्ध से तबाह हो चुकी है। कई वर्षों बाद एक रहस्यमय टूर्नामेंट की घोषणा होती है, जिसमें दुनिया भर के योद्धाओं को यह वादा करके बुलाया जाता है कि विजेता की कोई भी इच्छा पूरी की जाएगी। प्रतिभागियों में Sol Badguy भी शामिल है, जो एक अकेला बाउंटी हंटर है और Gears, विशेष रूप से Justice, से व्यक्तिगत बदला लेना चाहता है, क्योंकि उसकी वापसी दुनिया को फिर से अराजकता में धकेल सकती है। जैसे-जैसे टूर्नामेंट आगे बढ़ता है, छिपी हुई साज़िशें, प्राचीन रहस्य और Gears की वास्तविक उत्पत्ति सामने आने लगती है। हर योद्धा अपने अलग उद्देश्य के लिए लड़ रहा है, चाहे वह प्रतिशोध हो, प्रायश्चित, कर्तव्य या जीवित रहने की चाह। डार्क फैंटेसी, साइंस फिक्शन और तेज़-रफ़्तार एक्शन का यह मिश्रण Guilty Gear ब्रह्मांड की नींव रखता है, जहाँ मानवता का अपनी ही रचनाओं से संघर्ष एक व्यक्तिगत और विश्व-परिवर्तनकारी युद्ध बन जाता है।