L'histoire de METAL GEAR SOLID 2: Sons of Liberty suit le jeune agent Raiden, chargé d'infiltrer une immense installation offshore appelée Big Shell après sa prise de contrôle par des terroristes menaçant de provoquer une catastrophe environnementale. Au fil de sa mission, il découvre que cette crise n'est qu'une infime partie d'un vaste complot impliquant des organisations secrètes, des manipulations politiques et la technologie avancée des Metal Gear. Guidé par des alliés familiers tout en étant entouré de tromperies, Raiden lutte pour distinguer la vérité des mensonges soigneusement orchestrés. Ses liens avec le légendaire Solid Snake et les mystérieux Patriots révèlent une conspiration qui remet en question la liberté, l'identité et le contrôle de l'information. Mêlant infiltration et réflexion philosophique, l'histoire offre de nombreux rebondissements et une exploration captivante du pouvoir à l'ère numérique.