بعد أحداث Halo 5: Guardians، يستيقظ Master Chief تائهًا في الفضاء بعد أن تعرضت البشرية لهزيمة مدمرة. ينقذه طيار وحيد ويعود إلى الحلقة المحطمة المعروفة باسم Zeta Halo، حيث تسيطر قوات Banished بقيادة Escharum على المنطقة. وأثناء استكشافه للحلقة، يكتشف مصير حلفائه المفقودين ويواجه تهديدًا جديدًا وقويًا مرتبطًا بالغامضين Endless. وبمساعدة رفيقة ذكاء اصطناعي جديدة تُدعى The Weapon، يكشف أسرارًا مدفونة في عالم الـ Forerunner القديم، بينما يواجه أصداءً من ماضيه. وبينما يخوض معارك شرسة، يعيد Master Chief الأمل إلى الناجين من قوات UNSC ويقود البشرية من جديد في كفاحها من أجل البقاء. وتمزج القصة بين التأمل الشخصي والحرب واسعة النطاق، لتقدم رحلة مؤثرة عن الصمود والتضحية وشجاعة أحد أعظم الـ Spartan.