Assassin’s Creed Origins conta a história de Bayek, um habilidoso guerreiro Medjay no Egito Antigo, movido por um profundo desejo de justiça após uma tragédia pessoal que destrói sua vida. Ao atravessar vastos desertos, cidades movimentadas e templos sagrados, ele descobre uma conspiração oculta que ameaça a terra e seu povo. Ao lado de sua esposa Aya, Bayek se envolve em conflitos políticos com governantes poderosos e grupos secretos. Sua busca por vingança gradualmente se transforma em algo maior, dando origem à Irmandade dos Assassinos. O jogo explora temas como perda, lealdade e o preço da vingança, em um cenário histórico rico em detalhes. Encontros com figuras e eventos históricos acrescentam profundidade à narrativa. Os dilemas morais de Bayek moldam seu caminho. No final, a história revela a origem de um credo que ecoará através do tempo.