Assassin’s Creed Origins की कहानी बायक नामक एक कुशल मेडजाय योद्धा के इर्द-गिर्द घूमती है, जो प्राचीन मिस्र में एक व्यक्तिगत त्रासदी के बाद न्याय की गहरी चाह से प्रेरित होता है। विशाल रेगिस्तानों, जीवंत शहरों और पवित्र मंदिरों की यात्रा के दौरान, वह एक छिपी साजिश का पता लगाता है जो देश और उसके लोगों को खतरे में डालती है। अपनी पत्नी आया के साथ, बायक शक्तिशाली शासकों और गुप्त समूहों से जुड़ी राजनीतिक संघर्षों में उलझ जाता है। उसकी बदले की यात्रा धीरे-धीरे एक बड़े उद्देश्य में बदल जाती है, जो असैसिन ब्रदरहुड की नींव रखती है। कहानी हानि, निष्ठा और बदले की कीमत जैसे विषयों की पड़ताल करती है। ऐतिहासिक व्यक्तियों और घटनाओं से मुलाकात कथा को और गहराई देती है। बायक के नैतिक संघर्ष उसकी राह को आकार देते हैं। अंततः, यह कहानी एक ऐसे सिद्धांत की उत्पत्ति को दर्शाती है जो समय के साथ गूंजता रहेगा।