GUILTY GEAR 2 -OVERTURE- acontece após os eventos dos jogos originais de Guilty Gear e acompanha o lendário Sol Badguy, que é envolvido em um novo conflito capaz de destruir a frágil paz entre humanos e Gears. Quando a misteriosa Valentine inicia uma invasão utilizando criaturas poderosas conhecidas como Servants, Sol une forças com antigos e novos aliados para descobrir a verdade por trás de seus objetivos. Ao mesmo tempo, Sin Kiske, o jovem filho de Ky Kiske e Dizzy, inicia sua própria jornada e se torna uma peça fundamental na batalha. Enquanto antigas conspirações, magia poderosa e tecnologia avançada entram em choque, os heróis enfrentam inimigos formidáveis e decisões difíceis. Sua luta revela segredos há muito escondidos sobre o mundo e a origem de suas maiores ameaças, preparando o caminho para o próximo capítulo da saga Guilty Gear.