Stronghold 3 conta a história de um reino que tenta se recuperar de anos de guerra e destruição, apenas para enfrentar novamente o retorno do famoso inimigo “Wolf”, que todos acreditavam estar morto. Enquanto vilarejos são reconstruídos e alianças são formadas, “Wolf” lança uma campanha brutal de destruição pelo país, forçando os jogadores a defender inocentes e reunir suas forças leais. Ao longo da campanha, os jogadores devem coletar recursos, construir castelos poderosos e liderar exércitos contra inimigos cada vez mais perigosos. A história segue um clássico conto medieval de vingança, sobrevivência e a luta para restaurar a paz em um reino destruído. Com maior foco em cercos a castelos, o jogo mistura estratégia e batalhas épicas.