Lara Croft and the Guardian of Lightでは、Lara Croft が中央アメリカの山岳地帯にある古代神殿へ向かい、伝説の Mirror of Smoke を探し求める壮大な冒険に挑みます。しかし、冷酷な傭兵 Vasco がその秘宝を盗み出したことで、世界を闇に包もうとする邪悪な精霊 Xolotl が誤って解放されてしまいます。この脅威を阻止するため、Lara は何世紀にもわたり神殿を守り続けてきた古代の戦士 Totec と予想外の同盟を結びます。二人は忘れ去られた遺跡や危険な罠、神話上の怪物が潜む超自然的な戦場を進んでいきます。聖なる遺物を集めながら強大な敵に立ち向かう中で、彼らは数々の試練と互いの違いを乗り越えなければなりません。やがてその旅は、Xolotl が究極の力を手に入れ、世界に混乱をもたらすのを阻止するための時間との戦いへと発展していきます。