В Warhammer 40,000: Rogue Trader игрок берет на себя роль могущественного Rogue Trader — привилегированного исследователя, наделенного особыми полномочиями Imperium of Man для путешествий за пределами известного космоса. События разворачиваются в мрачной и беспощадной атмосфере 41-го тысячелетия в регионе Koronus Expanse, где скрываются древние тайны, инопланетные угрозы, политические интриги и разрушительные войны. Будучи капитаном огромного космического корабля, вам предстоит принимать сложные решения, влияющие на судьбы целых миров, заключать союзы с верными спутниками и противостоять всепроникающему влиянию Chaos. Благодаря глубокому повествованию и масштабным приключениям игра предлагает захватывающее путешествие по одной из самых известных и суровых научно-фантастических вселенных.