Nesta obra-prima de 1998 que lançou uma franquia lendária, Tom Clancy's Rainbow Six acompanha a criação da "Rainbow", uma unidade antiterrorista multinacional de elite e secreta liderada pelo Diretor John Clark. Ambientado no então futuro próximo de 1999, o jogo lança os jogadores em um thriller geopolítico emocionante enquanto a Rainbow é implantada para neutralizar uma onda súbita e suspeita de ataques terroristas globais. À medida que a equipe frustra com sucesso operações que variam de uma crise de reféns em um parque de diversões a uma invasão biológica em uma instalação de pesquisa, eles descobrem um fio sinistro que conecta todas elas. O mentor é a Horizon Corp., uma corporação ecoterrorista radical que planeja liberar um vírus global devastador chamado "Brahma" para exterminar a maior parte da humanidade, deixando apenas alguns escolhidos para reconstruir uma Terra intocada. É uma corrida contra o tempo de alto risco, onde a precisão tática e o trabalho em equipe perfeito são as únicas coisas que se opõem à utopia de um louco e à extinção humana total.