Red Faction Guerrilla Re-Mars-tered की कहानी मूल Red Faction की घटनाओं के पचास वर्ष बाद घटित होती है। इसमें Alec Mason की कहानी दिखाई गई है, जो एक विस्फोट विशेषज्ञ है और नई शुरुआत की उम्मीद में मंगल ग्रह पर आता है, लेकिन वहाँ उसे Earth Defence Force (EDF) का दमनकारी शासन मिलता है। एक व्यक्तिगत त्रासदी के बाद, जब उसके पास खोने के लिए कुछ नहीं बचता, तो Alec गुप्त Red Faction प्रतिरोध आंदोलन में शामिल हो जाता है और उपनिवेशवासियों के लिए आशा का प्रतीक बन जाता है। शक्तिशाली विस्फोटकों, अस्थायी हथियारों और गुरिल्ला रणनीतियों की मदद से वह EDF की सैन्य शक्ति को कमजोर करने और मंगल की बस्तियों को मुक्त कराने का अभियान चलाता है। जैसे-जैसे विद्रोह फैलता है, हर नष्ट की गई चौकी दुश्मन की पकड़ को कमजोर करती है और अंततः मंगल के भविष्य तथा उसके लोगों की आज़ादी के लिए निर्णायक संघर्ष शुरू होता है।

Red Faction: Armageddon की कहानी Red Faction: Guerrilla की घटनाओं के पचास वर्ष बाद की है, जहाँ Darius Mason, महान Alec Mason का वंशज, तबाही से बर्बाद मंगल ग्रह की सतह के नीचे मानवता के अस्तित्व के लिए संघर्ष करता है। धोखे का शिकार होकर Darius एक रहस्यमयी प्राचीन मुहर खोल देता है, जिससे अनजाने में एक भयावह एलियन जाति मुक्त हो जाती है जो बचे हुए मानव उपनिवेशों का विनाश करना चाहती है। इस आपदा के लिए दोषी ठहराए जाने के बाद, वह कुछ बचे हुए लोगों के साथ मिलकर इस खतरे का सामना करता है और मंगल की प्राचीन सभ्यता के रहस्यों को उजागर करने निकलता है। शक्तिशाली हथियारों और उन्नत तकनीक से लैस Darius ढही हुई सुरंगों, परित्यक्त बस्तियों और एलियनों से भरी गुफाओं में लड़ाई करता है। जब पूरे मंगल का भविष्य दाँव पर होता है, तब उसे अपनी गलतियों का सामना करते हुए मानवता को विनाश से बचाना होता है।

Red Faction: Guerrilla – Steam Edition की कहानी मूल Red Faction की घटनाओं के पचास वर्ष बाद घटित होती है। इसमें खनन अभियंता Alec Mason मंगल ग्रह पर नई शुरुआत की उम्मीद लेकर आता है, लेकिन Earth Defence Force (EDF) द्वारा उसके भाई की हत्या के बाद उसका जीवन बदल जाता है। शोक और न्याय की भावना से प्रेरित होकर वह गुप्त Red Faction विद्रोह में शामिल हो जाता है, जिसका उद्देश्य मंगल की बस्तियों को सैन्य दमन से मुक्त कराना है। शक्तिशाली हथियारों, विस्फोटकों और गुरिल्ला रणनीतियों की मदद से वह EDF के ठिकानों पर हमला करता है और आम लोगों को विद्रोह के लिए प्रेरित करता है। जैसे-जैसे क्रांति पूरे खुले संसार में फैलती है, हर सफलता EDF की पकड़ को कमजोर करती है और स्वतंत्रता की उम्मीद को मजबूत बनाती है। अपनी यात्रा के दौरान Alec कब्जे के पीछे छिपी गहरी साज़िशों का पता लगाता है और यह तय करता है कि अपने उद्देश्य के लिए वह कितनी दूर तक जाने को तैयार है। यह कहानी व्यक्तिगत बदले और आज़ादी की लड़ाई को रोमांचक एक्शन के साथ जोड़ती है, जहाँ विनाश ही क्रांति का सबसे प्रभावी हथियार बन जाता है।