The Legend of Zelda: Breath of the Wild की कहानी श्रृंखला के बाद आने वाले रोमांचों से बहुत पहले घटित होती है और Link की यात्रा का अनुसरण करती है, जो एक महान योद्धा है और सौ वर्षों की नींद से अपनी याददाश्त खोकर जागता है। उसे पता चलता है कि Hyrule का राज्य प्राचीन दुष्ट शक्ति Calamity Ganon की वापसी से तबाह हो चुका है, जबकि Princess Zelda पूरे एक शताब्दी से इस अंधकारमय शक्ति को रोकने के लिए संघर्ष कर रही है। रहस्यमयी आवाज़ों और बिखरी हुई यादों के मार्गदर्शन में, Link एक विशाल खुले संसार की खोज करता है जो खंडहर बने शहरों, ऊँचे पहाड़ों, छिपे हुए मंदिरों और प्राचीन तकनीकों से भरा हुआ है। अपनी यात्रा के दौरान वह अपने सहयोगियों से फिर मिलता है, शक्तिशाली Divine Beasts को मुक्त करता है और Hyrule के पतन की दुखद कहानी को उजागर करता है। हर यात्रा खिलाड़ी के निर्णयों के अनुसार आकार लेती है, जिससे खोज और अन्वेषण अनुभव का महत्वपूर्ण हिस्सा बन जाते हैं। अंततः, Link को अपनी शक्ति वापस प्राप्त करनी होगी, राज्य में आशा लौटानी होगी और Princess Zelda के साथ मिलकर Hyrule को शाश्वत विनाश से बचाना होगा।