Se déroulant dans un avenir proche en 2014, Tom Clancy's Ghost Recon Advanced Warfighter 2 plonge à nouveau les joueurs dans les bottes tactiques du Captain Scott Mitchell alors qu'il dirige l'élite des "Ghosts" dans un conflit à haut risque à la frontière américano-mexicaine. Suite aux événements du premier jeu, un Mexique fragile est déchiré par une violente guerre civile entre les forces loyalistes et une faction rebelle radicale. Lorsque les insurgés acquièrent des têtes nucléaires volées, menaçant à la fois la stabilité du Mexique et le sol américain, les Ghosts sont déployés à El Paso, au Texas, et à Juárez pour neutraliser la menace. Opérant dans une fenêtre serrée de 72 heures, l'équipe de Mitchell doit utiliser une technologie militaire de pointe, coordonner avec les forces alliées locales et exécuter des frappes précises pour empêcher une détonation nucléaire catastrophique. C'est un récit militaire captivant et au rythme effréné qui équilibre magistralement la tension géopolitique et la guerre tactique intense en escouade.